微生物的 分类单元及其等级

　　界Kingdom

　　门Phylum——亚门

　　纲Class——亚纲

　　目Order——亚目

　　科Family——亚科

　　属Genus

　　种Species

分类单元的命名

　　⑴ 属名。用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。

　　⑵ 种名。和其他生物一样，细菌的种名也用双名法（binomial nomenclature）命名，即种的学名由属名和种名加词两部分组合而成。

　　⑶ 亚种名。亚种名为三元式组合，即由属名、种名加词和亚种名加词构成。

　　　细菌的命名依据“国际细菌命名法规”的规定，学名用拉丁文，遵循 林奈的“双名法”， 这种国际命名法的一般规则如下：
　　　① 每一种具有显著区分的微生物，称之为“种”。
　　　② 每一个种给一个名字，其学名通常是用2个拉丁词组成。
　　　③ 学名的第一个词是属名，属名的第一个字母要大写。属名是拉丁词或希腊词或拉丁化了的 其他文字所构成。它是一个名词，用以表示该属的主要特征。属名有时可用人名或地名来 表示，如Pasteurella pestis (鼠疫巴斯德氏菌)、志贺氏杆菌属。
　　　　属名在上下文重复出现的情况下，可以缩写表示，如Bacillus可用Bac.表示。
　　　④ 学名的第二个词为种名。种名是拉丁语中的形容词，表示微生物的次要特征，如金黄色葡萄 球菌(Staphyloccocus aureus)中的“aureus”是形容词，意思是“金黄色的”。
　　　⑤ 种名也有用人名或地名来表示的，如巴氏芽孢杆菌(Bacillus pasteurii)。种名首字母不大写。

　　　学名在印刷时，要用斜体字表示，或者在正排字下面加一条横线表示。
　　　　值得注意的是，在属以上的名称，如 门、纲、目、科等，其名称第一个字母要大写，是正体。

　　　⑥ 通常在种名的后面还跟着命名这个种的人的姓以及命名时间。这是由于自然界中的种实在 太多了，大家都在命名，容易混淆误解，所以要在正式的拉丁名称之后附上命名人的姓名和 命名时间。如果对以前的命名有所改动，也有一定的规则，如枯草芽孢杆菌，最早（1838 年）由Ehrenberg描述，定名为“Vibrio subtilis（枯草弧菌）Ehrenberg，1838”。到了1872 年，Cohn认为弧状不是它的特征，提出转属，但保留其种名，更名为Bacillus subtilis（Ehrenberg） Cohn ，1872”。学名中用括号把最初定名人保留下来，括号外加上改名人的姓氏和改名时间， 借以表明这个种的命名演变过程。
　　在这里，有一点需要指出，种名后附加的人名，并非完全表示这个人是第一个发现和研究这种微生物的，而是指该人首先给它定名。 命名人的姓一律用正体。

　　综上所述，微生物学名的格式如下：
　　学名=属名+种名+（最初定名人）+后来定名人+改名时间
　　主要部分 次要部分（一般可省略）
　　　⑦ 有时，“种”还须区分成亚种，就要在学名后面附加拉丁词表示。 有时只讲某一属的菌，不讲 某一个具体的种，或没有种名时，可用属名后加sp.（表示单数）或spp.（表示复数）表示，如Bacillius. sp.泛指芽孢杆菌属中任何一个种；如果是Bacillius. spp.就表示该菌中的某几个种。经鉴定为新菌种时，应在给予它的新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，如新属“gen.nov”、新种“sp.nov.”等。

　　每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余均应小字。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。 如：Escherichia coli （属名+种名）

几种不同的书写情况

　　1) 属名重复出现，可缩写如：E. coli （大肠杆菌）；S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌）；

　　2) 只确定属名，未确定种名的某一株细菌，如Salmonella sp.；

　　3) 只确定属名，未确定种名的若干菌株，如Salmonella spp.；

　　4) 亚种用subsp. 或者ssp.（subspecies）表示Pasteurella multocida subsp.

　　5) 发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。但若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合格发表，也不能取得国际上的承认。